妈阁交通枢纽地库层设有停车场，於地库二层提供重型客车泊车位，现时对外开放，驾驶者请留意停车场出入口位置。
| 位置： | 妈阁交通枢纽地库二层 | |
| 出入口： | 出入口与巴士驶入交通枢纽的位置相同，驾驶者可按指示经分岔路进出停车场 | |
| 停泊位： | 27 个泊车位 及 6 个临时上落客车位 | |
| 收费： | 08:00 至 20:00 前 | 每小时或不足 1 小时收费 12 澳门元 |
| 其馀时段 | 每小时或不足 1 小时收费 6 澳门元 | |
| 备注： | 1. 当车辆连续泊车超过停车场规定之泊车时间上限，其后（即由连续停泊第九日起）每小时或不足一小时收取双倍的泊车费用 2. 首一小时免费泊车优惠时间：2025年6月15日 00:00 至 2025年12月31日 23:59 |
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